日本で最もポピュラーな真珠はアコヤ真珠ではないでしょうか。日本の養殖真珠のほぼ全てを占めます。色はホワイト・ピンク・クリーム・ゴールド。

標準径6～8ミリ、最大径12ミリ程度で、真珠の中でも干渉色と言われる光学現象である「テリ」を最も強く感じます。宝石の女王と言われるに相応しい品種です。綺麗なネックレスの連で、テリが均一なもの程、高額買取が期待できます。

シロチョウ真珠（白蝶,南洋,サウスパール）は、ホワイト・シルバー・クリーム・イエロー・ゴールドで、径10～16ミリ程の大珠が多く、巻きも多いので変形が多く、形のバリエーションが豊かなのも特徴。

アコヤが静かな海流での人工採苗に対し、シロチョウは潮の流れの強い南洋（オーストラリアやインドネシアやフィリピン、ミャンマー等）で天然採苗されます。

クロチョウ真珠は、通称「黒真珠」と呼ばれ、ブラック・グレー・ブルー・ブラウン・レッド・グリーンがあります。最高品質は「ピーコックカラー」と呼ばれるグリーンとレッドを帯びた黒色。形がいびつなバロック形も多いのも特徴。昔は高価なクロチョウだったため、シロチョウを染め直して（銀塩処理）クロチョウにしたものも多くあります。

天然真珠で有名なものは、ピンク色のコンクパール。カリブ海に生息する巻貝のコンク貝が母貝。独特の火焔模様(フレーム)が特徴的で、かなりの高額買取が期待できます。その他にアコヤの仲間のピピや、淡水二枚貝のドックティースやフェザー、アワビ等が天然真珠として有名です。

淡水真珠は、上で紹介した真珠の様に海では無く、湖や河で生息する貝（イケチョウ貝やカラス貝）から採れる真珠です。

小粒で形の歪なバロック形が多いのですが、近年、中国で超テリを発する径10ミリ程の真円の真珠の養殖に成功し、国内の真珠業界を戦々恐々とさせています。中国が全世界生産量の95%以上を占めており、過剰供給から市場価格が低落している為、比較的安価な形の小さな歪なアクセサリーによく使われます。